Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GATMP50440 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATMP50440 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATMP50440 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATMP50440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATMP50440 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GATMP50440 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATMP50440 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATMP50440 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATMP50440 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATMP50440 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATMP50440 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GATMP50440 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATMP50440 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATMP50440 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATMP50440 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATMP50440 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATMP50440 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATMP50440 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATMP50440 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATMP50440 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATMP50440 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GATMP50440 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATMP50440 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATMP50440 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATMP50440 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATMP50440 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATMP50440 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATMP50440 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATMP50440 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATMP50440 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATMP50440 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATMP50440 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATMP50440 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATMP50440 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATMP50440 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATMP50440 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATMP50440 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATMP50440 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATMP50440 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATMP50440 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATMP50440 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATMP50440 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GATMP50440 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATMP50440 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATMP50440 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATMP50440 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATMP50440 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATMP50440 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATMP50440 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms