Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLCP48506 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCLCP48506 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLCP48506 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLCP48506 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLCP48506 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLCP48506 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLCP48506 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLCP48506 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLCP48506 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLCP48506 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLCP48506 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GCLCP48506 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCLCP48506 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GCLCP48506 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCLCP48506 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLCP48506 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLCP48506 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLCP48506 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLCP48506 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLCP48506 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLCP48506 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLCP48506 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLCP48506 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLCP48506 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLCP48506 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLCP48506 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLCP48506 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCLCP48506 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCLCP48506 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCLCP48506 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCLCP48506 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GCLCP48506 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GCLCP48506 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GCLCP48506 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GCLCP48506 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCLCP48506 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCLCP48506 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCLCP48506 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCLCP48506 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCLCP48506 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCLCP48506 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms