Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA4P48058 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA4P48058 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA4P48058 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms