Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCC3P46736 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRCC3P46736 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRCC3P46736 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms