Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR4A2P43354 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NR4A2P43354 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR4A2P43354 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR4A2P43354 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR4A2P43354 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR4A2P43354 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR4A2P43354 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR4A2P43354 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR4A2P43354 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR4A2P43354 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NR4A2P43354 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR4A2P43354 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR4A2P43354 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR4A2P43354 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR4A2P43354 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR4A2P43354 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms