Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFRP42898 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFRP42898 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFRP42898 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms