Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR1P36897 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR1P36897 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms