Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTPDP35247 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTPDP35247 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTPDP35247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms