Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RCVRNP35243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RCVRNP35243 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms