Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CA5AP35218 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CA5AP35218 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CA5AP35218 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CA5AP35218 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CA5AP35218 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA5AP35218 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA5AP35218 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA5AP35218 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CA5AP35218 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CA5AP35218 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA5AP35218 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CA5AP35218 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA5AP35218 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CA5AP35218 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA5AP35218 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA5AP35218 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA5AP35218 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA5AP35218 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA5AP35218 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA5AP35218 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA5AP35218 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA5AP35218 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA5AP35218 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA5AP35218 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CA5AP35218 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA5AP35218 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA5AP35218 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA5AP35218 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA5AP35218 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms