Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC8P31273 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOXC8P31273 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXC8P31273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXC8P31273 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms