Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHATP28329 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHATP28329 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHATP28329 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHATP28329 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHATP28329 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHATP28329 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHATP28329 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHATP28329 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHATP28329 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHATP28329 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHATP28329 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHATP28329 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHATP28329 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHATP28329 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHATP28329 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHATP28329 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHATP28329 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms