Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPA1P27694 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPA1P27694 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPA1P27694 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPA1P27694 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPA1P27694 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPA1P27694 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA1P27694 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA1P27694 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPA1P27694 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA1P27694 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA1P27694 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA1P27694 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA1P27694 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPA1P27694 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPA1P27694 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPA1P27694 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPA1P27694 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPA1P27694 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPA1P27694 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPA1P27694 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPA1P27694 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPA1P27694 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPA1P27694 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPA1P27694 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPA1P27694 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPA1P27694 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA1P27694 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA1P27694 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPA1P27694 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPA1P27694 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPA1P27694 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPA1P27694 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPA1P27694 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPA1P27694 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPA1P27694 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms