Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA2P24043 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA2P24043 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA2P24043 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms