Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A2P23975 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A2P23975 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A2P23975 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms