Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.724e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)4.2□□□□□ -1.744e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CD3D-203ENST00000526561 257 ntTSL 23.58□□□□□ -1.844e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-208ENST00000628734 600 ntTSL 23.23□□□□□ -1.898e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNAP23-218ENST00000568514 1018 ntTSL 33.04□□□□□ -1.924e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.944e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MATR3-226ENST00000515833 1001 ntTSL 52.78□□□□□ -1.964e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -24e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 CDC6-202ENST00000473555 584 ntTSL 22.42□□□□□ -2.024e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 NBR1-204ENST00000586650 586 ntTSL 1 (best)2.06□□□□□ -2.084e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.114e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-208ENST00000483545 568 ntTSL 41.59□□□□□ -2.154e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MRPS22-206ENST00000480644 363 ntTSL 31.53□□□□□ -2.164e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UBE2A-203ENST00000371569 2643 ntTSL 1 (best)0.98□□□□□ -2.258e-8■■■■■ 40.4
RPS3P23396 DECR1-218ENST00000524326 679 ntTSL 30.96□□□□□ -2.264e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.44e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 MYO5A-208ENST00000469611 500 ntTSL 3-0.4□□□□□ -2.474e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 26.45□□□□□ -1.386e-17■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 210.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 28.28□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 27.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 40.4
RPS3P23396 GJB1-204ENST00000447581 484 ntTSL 58.82□□□□□ -14e-10■■■■■ 40.4
RPS3P23396 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 40.3
RPS3P23396 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 40.3
RPS3P23396 TK1-206ENST00000592126 631 ntTSL 319.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 40.3
RPS3P23396 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.489e-28■■■■■ 40.2
RPS3P23396 PEPD-211ENST00000593085 1763 ntTSL 220.14■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 40.2
RPS3P23396 IDH1-207ENST00000462386 1614 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 40.2
RPS3P23396 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 40.1
RPS3P23396 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 40.1
RPS3P23396 DDX56-211ENST00000479602 440 ntTSL 28.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 40
RPS3P23396 SLCO4A1-207ENST00000495889 543 ntTSL 315.86■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 40
RPS3P23396 SLCO4A1-205ENST00000466961 819 ntTSL 313.5□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 40
RPS3P23396 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 UNC45A-204ENST00000471780 1730 ntTSL 517.72■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 39.9
RPS3P23396 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 214.35□□□□□ -0.114e-9■■■■■ 39.9
RPS3P23396 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 39.9
RPS3P23396 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-9■■■■■ 39.9
RPS3P23396 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 39.9
RPS3P23396 HSD17B12-203ENST00000525736 4292 ntTSL 1 (best)7.31□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-206ENST00000496700 2241 ntTSL 222.8■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-204ENST00000460900 1443 ntTSL 222.27■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 AL928654.4-202ENST00000547940 435 ntTSL 517.38■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-205ENST00000461556 638 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 AL928654.4-201ENST00000477724 678 ntAPPRIS P5 TSL 413.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 AL928654.4-203ENST00000553228 337 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.82□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 39.9
RPS3P23396 PSMA4-214ENST00000559906 583 ntTSL 21.5□□□□□ -2.179e-9■■■■■ 39.8
RPS3P23396 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 39.8
RPS3P23396 HSPD1-207ENST00000439605 578 ntTSL 418.1■□□□□ 0.494e-61■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-205ENST00000428204 549 ntTSL 411.36□□□□□ -0.594e-61■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-211ENST00000476746 853 ntTSL 29.23□□□□□ -0.937e-28■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-209ENST00000452200 888 ntTSL 58.38□□□□□ -1.075e-28■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-210ENST00000461097 714 ntTSL 27.41□□□□□ -1.224e-61■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-208ENST00000440114 619 ntTSL 57.18□□□□□ -1.265e-28■■■■■ 39.7
RPS3P23396 HSPD1-204ENST00000426480 529 ntTSL 46.14□□□□□ -1.434e-61■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.55e-8■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SERPINE2-205ENST00000432738 988 ntTSL 314.53□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.985e-8■■■■■ 39.7
RPS3P23396 BCKDHA-207ENST00000544905 562 ntTSL 28.94□□□□□ -0.987e-8■■■■■ 39.7
RPS3P23396 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.499e-30■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SLC29A4-205ENST00000439491 805 ntTSL 314.45□□□□□ -0.19e-30■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.19e-30■■■■■ 39.7
RPS3P23396 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.219e-30■■■■■ 39.7
RPS3P23396 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.016e-13■■■■■ 39.6
RPS3P23396 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 39.6
RPS3P23396 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.039e-8■■■■■ 39.6
RPS3P23396 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.039e-8■■■■■ 39.6
RPS3P23396 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 313.23□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 39.6
RPS3P23396 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-13■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 218.32■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-202ENST00000329819 922 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-204ENST00000524576 2209 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-203ENST00000430466 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MRPL11-205ENST00000528272 506 ntTSL 35.8□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 39.6
RPS3P23396 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.383e-8■■■■■ 39.5
RPS3P23396 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 320.15■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 39.5
RPS3P23396 PCOLCE-203ENST00000462260 554 ntTSL 213.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 39.5
RPS3P23396 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 39.4
RPS3P23396 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 39.4
RPS3P23396 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 39.4
RPS3P23396 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 39.4
RPS3P23396 IMPDH2-208ENST00000481274 840 ntTSL 214.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 39.4
RPS3P23396 IMPDH2-209ENST00000484872 643 ntTSL 25.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 39.4
RPS3P23396 RAB11A-207ENST00000568850 551 ntTSL 411.5□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 39.4
RPS3P23396 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-13■■■■■ 39.4
RPS3P23396 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.472e-13■■■■■ 39.4
RPS3P23396 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-13■■■■■ 39.4
RPS3P23396 NRM-209ENST00000495946 1203 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 39.4
RPS3P23396 NRM-204ENST00000444096 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.81□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 39.4
RPS3P23396 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.017e-88■■■■■ 39.4
RPS3P23396 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.017e-88■■■■■ 39.4
RPS3P23396 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.037e-88■■■■■ 39.4
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