Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBG1P23258 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBG1P23258 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBG1P23258 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms