Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDCP19113 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDCP19113 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDCP19113 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDCP19113 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDCP19113 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDCP19113 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDCP19113 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDCP19113 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDCP19113 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDCP19113 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDCP19113 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDCP19113 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDCP19113 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDCP19113 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDCP19113 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDCP19113 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDCP19113 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDCP19113 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDCP19113 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDCP19113 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDCP19113 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDCP19113 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDCP19113 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDCP19113 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDCP19113 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDCP19113 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDCP19113 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDCP19113 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDCP19113 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDCP19113 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDCP19113 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDCP19113 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDCP19113 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDCP19113 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDCP19113 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms