Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GM2AP17900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GM2AP17900 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GM2AP17900 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GM2AP17900 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GM2AP17900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GM2AP17900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GM2AP17900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GM2AP17900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GM2AP17900 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GM2AP17900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GM2AP17900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GM2AP17900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GM2AP17900 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GM2AP17900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GM2AP17900 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GM2AP17900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GM2AP17900 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GM2AP17900 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GM2AP17900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GM2AP17900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GM2AP17900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GM2AP17900 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GM2AP17900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GM2AP17900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GM2AP17900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms