Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DESP17661 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DESP17661 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DESP17661 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DESP17661 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DESP17661 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DESP17661 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DESP17661 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DESP17661 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DESP17661 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DESP17661 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DESP17661 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DESP17661 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DESP17661 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DESP17661 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DESP17661 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DESP17661 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DESP17661 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DESP17661 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DESP17661 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DESP17661 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DESP17661 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DESP17661 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DESP17661 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DESP17661 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DESP17661 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DESP17661 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DESP17661 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DESP17661 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DESP17661 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DESP17661 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DESP17661 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DESP17661 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DESP17661 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DESP17661 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DESP17661 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DESP17661 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DESP17661 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DESP17661 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DESP17661 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DESP17661 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DESP17661 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DESP17661 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DESP17661 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DESP17661 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms