Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCFC2P16383 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCFC2P16383 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms