Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV1P15498 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV1P15498 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV1P15498 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV1P15498 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAV1P15498 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV1P15498 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV1P15498 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV1P15498 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV1P15498 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAV1P15498 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV1P15498 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAV1P15498 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV1P15498 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV1P15498 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAV1P15498 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV1P15498 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV1P15498 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV1P15498 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV1P15498 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAV1P15498 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAV1P15498 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV1P15498 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV1P15498 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV1P15498 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAV1P15498 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAV1P15498 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV1P15498 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV1P15498 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV1P15498 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV1P15498 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAV1P15498 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV1P15498 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAV1P15498 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAV1P15498 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAV1P15498 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV1P15498 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV1P15498 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAV1P15498 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAV1P15498 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV1P15498 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV1P15498 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAV1P15498 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VAV1P15498 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV1P15498 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV1P15498 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAV1P15498 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAV1P15498 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAV1P15498 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV1P15498 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAV1P15498 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms