Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOLR1P15328 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOLR1P15328 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOLR1P15328 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms