Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB3P14651 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms