Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYL4P12829 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYL4P12829 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYL4P12829 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL4P12829 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL4P12829 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL4P12829 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYL4P12829 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYL4P12829 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYL4P12829 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL4P12829 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL4P12829 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL4P12829 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYL4P12829 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYL4P12829 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL4P12829 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYL4P12829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYL4P12829 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYL4P12829 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYL4P12829 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL4P12829 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL4P12829 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL4P12829 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MYL4P12829 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL4P12829 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL4P12829 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYL4P12829 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL4P12829 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL4P12829 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL4P12829 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL4P12829 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYL4P12829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYL4P12829 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL4P12829 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL4P12829 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL4P12829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYL4P12829 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYL4P12829 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYL4P12829 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms