Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGAMP11215 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAMP11215 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAMP11215 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms