Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THRAP10827 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THRAP10827 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THRAP10827 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THRAP10827 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THRAP10827 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THRAP10827 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THRAP10827 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THRAP10827 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
THRAP10827 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THRAP10827 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THRAP10827 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THRAP10827 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THRAP10827 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP10827 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP10827 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THRAP10827 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP10827 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP10827 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THRAP10827 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP10827 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP10827 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THRAP10827 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
THRAP10827 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP10827 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP10827 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP10827 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP10827 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP10827 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THRAP10827 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP10827 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP10827 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP10827 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms