Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYNP07948 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LYNP07948 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNP07948 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNP07948 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNP07948 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNP07948 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYNP07948 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYNP07948 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYNP07948 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYNP07948 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYNP07948 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYNP07948 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNP07948 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNP07948 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNP07948 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNP07948 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYNP07948 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYNP07948 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYNP07948 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYNP07948 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYNP07948 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYNP07948 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNP07948 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYNP07948 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYNP07948 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYNP07948 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYNP07948 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms