Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN3P07498 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN3P07498 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CSN3P07498 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSN3P07498 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN3P07498 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN3P07498 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN3P07498 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN3P07498 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN3P07498 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSN3P07498 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN3P07498 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN3P07498 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms