Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CENPBP07199 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CENPBP07199 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CENPBP07199 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CENPBP07199 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CENPBP07199 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CENPBP07199 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CENPBP07199 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CENPBP07199 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CENPBP07199 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPBP07199 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPBP07199 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPBP07199 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPBP07199 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CENPBP07199 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CENPBP07199 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CENPBP07199 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CENPBP07199 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CENPBP07199 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CENPBP07199 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CENPBP07199 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CENPBP07199 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CENPBP07199 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CENPBP07199 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CENPBP07199 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CENPBP07199 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CENPBP07199 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CENPBP07199 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CENPBP07199 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CENPBP07199 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CENPBP07199 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CENPBP07199 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CENPBP07199 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CENPBP07199 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CENPBP07199 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CENPBP07199 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CENPBP07199 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CENPBP07199 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CENPBP07199 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CENPBP07199 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPBP07199 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPBP07199 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CENPBP07199 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CENPBP07199 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CENPBP07199 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CENPBP07199 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPBP07199 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPBP07199 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPBP07199 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPBP07199 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CENPBP07199 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CENPBP07199 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CENPBP07199 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CENPBP07199 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CENPBP07199 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CENPBP07199 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CENPBP07199 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CENPBP07199 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms