Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFP01133 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFP01133 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFP01133 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFP01133 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFP01133 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFP01133 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFP01133 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFP01133 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFP01133 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFP01133 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFP01133 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFP01133 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFP01133 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFP01133 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFP01133 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFP01133 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFP01133 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFP01133 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFP01133 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFP01133 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFP01133 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFP01133 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFP01133 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFP01133 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFP01133 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFP01133 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFP01133 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFP01133 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFP01133 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFP01133 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFP01133 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFP01133 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFP01133 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFP01133 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFP01133 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFP01133 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFP01133 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFP01133 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFP01133 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFP01133 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFP01133 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFP01133 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFP01133 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFP01133 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFP01133 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFP01133 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFP01133 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFP01133 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFP01133 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EGFP01133 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms