Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE6O95741 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms