Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAMBPO95630 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAMBPO95630 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms