Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFASCO94856 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFASCO94856 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFASCO94856 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFASCO94856 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFASCO94856 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFASCO94856 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFASCO94856 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFASCO94856 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFASCO94856 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFASCO94856 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFASCO94856 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFASCO94856 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFASCO94856 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFASCO94856 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFASCO94856 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFASCO94856 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFASCO94856 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFASCO94856 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NFASCO94856 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFASCO94856 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFASCO94856 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFASCO94856 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFASCO94856 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFASCO94856 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFASCO94856 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFASCO94856 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFASCO94856 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFASCO94856 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFASCO94856 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFASCO94856 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFASCO94856 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFASCO94856 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFASCO94856 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFASCO94856 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFASCO94856 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFASCO94856 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFASCO94856 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFASCO94856 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFASCO94856 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFASCO94856 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFASCO94856 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFASCO94856 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFASCO94856 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFASCO94856 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NFASCO94856 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFASCO94856 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFASCO94856 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFASCO94856 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms