Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAPN15O75808 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN15O75808 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN15O75808 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN15O75808 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms