Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA4O75335 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA4O75335 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA4O75335 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.5 ms