Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME2P1O60361 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME2P1O60361 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME2P1O60361 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms