Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXTL3O43909 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EXTL3O43909 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXTL3O43909 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms