Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP1G1O43747 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP1G1O43747 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1G1O43747 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1G1O43747 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP1G1O43747 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms