Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF4O43474 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF4O43474 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF4O43474 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF4O43474 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF4O43474 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF4O43474 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF4O43474 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF4O43474 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF4O43474 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF4O43474 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF4O43474 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF4O43474 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF4O43474 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF4O43474 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF4O43474 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF4O43474 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF4O43474 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF4O43474 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF4O43474 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF4O43474 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF4O43474 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms