Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA2O43464 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTRA2O43464 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms