Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUV39H1O43463 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUV39H1O43463 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUV39H1O43463 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUV39H1O43463 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms