Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VILLO15195 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VILLO15195 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VILLO15195 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VILLO15195 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VILLO15195 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VILLO15195 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VILLO15195 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VILLO15195 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VILLO15195 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VILLO15195 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VILLO15195 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VILLO15195 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VILLO15195 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VILLO15195 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VILLO15195 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VILLO15195 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VILLO15195 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VILLO15195 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VILLO15195 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VILLO15195 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VILLO15195 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VILLO15195 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VILLO15195 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VILLO15195 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VILLO15195 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VILLO15195 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VILLO15195 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VILLO15195 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VILLO15195 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VILLO15195 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VILLO15195 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms