Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEMA3EO15041 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA3EO15041 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA3EO15041 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA3EO15041 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms