Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAMP3O14828 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAMP3O14828 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCAMP3O14828 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAMP3O14828 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms