Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFKBIEO00221 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFKBIEO00221 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFKBIEO00221 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms