Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAPO00193 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAPO00193 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAPO00193 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAPO00193 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAPO00193 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAPO00193 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAPO00193 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAPO00193 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAPO00193 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAPO00193 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAPO00193 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAPO00193 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAPO00193 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAPO00193 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAPO00193 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAPO00193 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAPO00193 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAPO00193 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAPO00193 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAPO00193 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms