Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PROB1E7EW31 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PROB1E7EW31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROB1E7EW31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROB1E7EW31 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms