Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf58C9J3I9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf58C9J3I9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms