Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L5A8MUK1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L5A8MUK1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L5A8MUK1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms